Поиск по PDB и содержание PDB файлов

1. Occupancy, не равный 1

Была выбрана структура 3akq (xylanase from Trichoderma longibrachiatum, 0.97Å resolution). Ниже приведено описание атомов OG A и В форм серина 36.

Первые три числа обозначают координаты атомов, четвертое - коэффициент occupancy. В одной половине молекул атом находится в точке с координатами из первой строчки, в другой половине - из второй.

2. Нерасшифрованные аминокислотные остатки

Выбрана структура 4yy3 (30S ribosomal subunit- HigB complex, 3.6Å resolution)

3. Несовпадение природной последовательности и кристаллизуемой

Была выбрана структура 5Z2H

В поле DBREF указано соответсвие последовательности базы данных PDB и Uniprot, в поле SEQADV - изменения по сравнению с нативной последовательностью

4. Худший и лучший B-фактор

Структура та же. B-фактор - последнее число в строке.

Худший

Лучший